暑期科研实习总结
201*年赴中国科学院广州生物医药与健康研究院
暑期科研实践报告
XXX
(XXX大学XXX学院XXX班)
引子
很久前就想借学院举办的暑期科研实践活动走出校园,零距离去接触真正的科研,看看科研的世界到底是怎么样的。出于对医学和生物学的热爱,我在列表中选择了广州生物医药与健康研究院。并开始做联系的准备。一开始了解到研究院不招收低年级本科实习生,我很失望和迷茫。但身为这个实习小组的组长,除了自己特别想去,还肩负着十余名同学的实习机会。我不放弃,通过邮件电话等方式,在研究院院长和科教处老师的帮助下,终于获得了这个机会。
通过有限的资源了解了研究院后,我选择了XX教授的实验组,主要研究干细胞与再生医学,而IPS正是其中一项。并且了解到国内iPS的研究在国际上不落人后,某些领域还处于领先地位,来自中科院广州生物医药与健康研究院的裴端卿教授就是其中突出的耕耘者之一。
第一次接触可诱导的多能干细胞(IPS)是在XX老师的细胞生物学这门课上,课间五分钟小演讲中一位同学提到的。IPS是通过在分化的体细胞中表达特定的转录因子以诱导体细胞的重编程而获得的可不断自我更新且具有多向分化潜能的细胞。干细胞的培养与运用在医学领域有着举足轻重的作用,近年来iPS的发现与发展更是为人类疾病的治疗,也为胚胎干细胞应用上的伦理道德问题找到了一个出路。我对这个领域的研究很有兴趣,想深入学习相关内容,于是抓住了这个机会。
初来乍到
就这样,怀着兴奋和好奇,7月21日,我跨进了研究院的大门。第一印象:非常安静和整洁,一切都那么井然有序,又仿佛能感觉到大脑急转的步伐和思想碰撞的声音。我知道,在这份安静底下,其实很多人在紧锣密鼓地忙碌着。
办完报到手续之后,在实验室小组长陈捷凯师兄的带领下,我来到了“体细胞重编程研究组”。边听着师兄的介绍,我打量着这块地盘。宽敞的分子实验平台和看起来“机关重重”的细胞间,就在实验室对面的研究员办公室,以及位于楼层另一边的电子阅览室,我那为期24天的暑期科研实践就将在这三点一面铺展开来。
到这工作不久的XX师兄很热情地接待我们,在这个人生地不熟的地方,顿时感觉很亲切。师兄简单地跟我们交流了生物学的一些话题,介绍了IPS的概况,又教我们查阅文献的方法和几个很实用的网站,我如获珍宝。实践证明,这些基本的学习手段和知识在日后的实习过程中发挥了很大的作用。
实习印记拾掇读文献
开始的两三天,每天的任务就是看文献,包括全英的论文。很早就听不少师兄姐说过,去实习第一要培养的是读文献的能力,果然如此。每天都只是看论文,确实挺单调,有个别同学动摇了,甚至第二天就退出了。我觉得很可惜,同时也更坚定了自己要坚持努力的决心。
我坚信,无论做什么,用心了就总会有收获,眼光也不能只放在当下。面对一个对自己
来说几乎是全新的东西,花时间先去了解它那是必须的,为以后更深入的学习和实践打下基础,这很合理。否则刚开始就动手操作,也不知从何做起,就算操作很正确也只是行尸走肉不知其意义何在。另一个也是因为自己兴趣所在,读得也津津有味。累了就时常想起自己的师兄曾用三天自学完一本全英教程,以此来激励自己。但我能力有限没能达到那个自学水平。这几天的埋头阅读,虽说不能百分百掌握所接触的内容,但对IPS这一领域,比起以前,总算有了个较清晰的轮廓,心里有底了。交流、取经
在学校学生工作中打拼了两年,觉得自己适应新的环境和新面孔的能力还可以。然而在研究院实践开始挺长的一段时间后我才感觉适应了那里的氛围。
一开始,总觉得师兄姐们都好忙,在实验室做完实验,又回到办公室对着电脑分析实验或看文献,相互之间似乎很少有什么要交流,但也经常看到XX,XX师兄和XX师兄在一起讨论。每个人在办公室里那种专注和安静竟然让我有种想逃开的冲动,我想这是一个满是研究人员的房间里很正常的氛围吧,是我还没习惯罢了。加上因为办公室安排不下,开始的几天又只是看文献,大部分时间待在阅览室,跟师兄姐接触较少,想交流的时候又觉得不知从何问起。
后来慢慢发现,其实是自己的主观意识先入为主,产生了敬畏心理,把师兄姐们抬得太高太难以接触了使自己把交流的主动性给丢了。而且我也再次感受到,好的交流也需要先成为朋友。后来越来越喜欢在实验室那边跟师兄姐们一起,发现其实师兄姐很愿意把自己知道的东西告诉我们,听多了就想得多,想多了就会问得多,自然就学到了更多。你希望别人怎么对你,你就怎么对别人,包括交流也是这样。而这一切都需要我们做到:主动。且行且思
专业知识掌握得不多,对于很多常挂在嘴边的专业知识都听不懂,看不明。电子阅览室是待得最多的地方了,平时没有实验的时候,大多数就去那查资料,把不懂的东西搜一遍,以后在接触到相关内容的时候就不会摸不着头脑了,解决力所能及的问题,也不用连一些看似很常识化的专业知识都去麻烦师兄姐,在这个阅览室,确实学到了很多东西。
在看和听的同时,要不断的思考,不要似懂非懂就放过去了。印象最深的就是学CHIP和甲基化检测这两个实验时,原理用途步骤都弄清楚后以为都懂了,再一想,根本不知道这两个技术是怎么服务于我们实验组现在IPS的研究中的。经过和其他师兄姐讨论,整理思路,找到最终不明白的地方,然后请教XX师兄终于弄明白,当时的感觉真是柳暗花明啊!
失败也是科研常遇之事。失败不可怕,重要的是要懂得不要对自己摆架子,把心态放低去思考,寻找错根,这时候对自己要求一定要严格,每一个看似不可能出错的步骤都有可能。我们做的甲基化实验就失败了两次,从所制备的试剂到实验条件到最后PCR的引物一一怀疑,要一步一步把好关卡才能做好。并且无论多简单的步骤都不能偷工减料,否则事倍功半。
关于做科研,感受最深的是,技术重要,但思维也很重要。科研者不仅知道怎么去做,最重要的是他知道为什么要这样做,知道需要这样做,他懂得怎样运用这些技术去达到自己的目的。所以在掌握操作技术时,最重要的还是要学会去想。另外,做科研要不断地去追寻最新的动态,不能只圈在自己的小世界里,但是,在摄入别人的成果时,要记住时刻保持质疑,敢于去质疑,全信则不如不信。师兄姐们在运用别人的成果之前,总要自己先验证,所谓实践是检验真理的唯一标准,用在这里也不为过。学无止境
每周一次的小组会议也是印象比较深刻的。除了讨论各自的工作进展外,还有论文的分享。我很欣赏这一点,虽然实验组里的人都很经常看文献,但就算看同一篇文章也会有不同的理解和想法。每周的组会让一个人来分析一篇较新的课题组相关的论文,让其他成员学到自己不知道的东西,也交流了大家的想法,学习别人的思维方式。据说还会有相关的专业课
题的讲授,让我深深感受到学无止境啊。术业有专功,每个人总有自己专长的,也就肯定有自己不懂的,只有不断地学习,才不会落后,懂得越多,也能更好的服务于自己的专长。
实习日程
时间7.21内容摘要报到了解实验室布局了解可诱导多功能干细胞(IPS)的概况了解基本的文献查阅、检索方法7.2223阅读IPS相关文献(体细胞重编程技术,什么是IPS,IPS的发现过程和获取方法,IPS的鉴定,IPS的研究方向)7.24查阅分子克隆相关内容观摩实验1、分子克隆的部分流程:菌落PCRDNA电泳阳性菌落扩增(保种,大提)2、质粒试剂盒抽提(小提)观摩实验:实时荧光定量PCR(RealTimePCR)XX师兄(实验室小组长,博士生)畅谈IPS并进行疑难解答查阅染色质免疫共沉淀(ChIP)相关内容开组会:实验室各成员工作汇报及讨论,XX师兄分享论文《epigeneticmemoryininducedpluripotentstemcells》进一步学习实时定量PCR(RealTimePCR)相关内容观摩实验:1、zed1基因的克隆过程2、RealTimePCR3、染色质免疫共沉淀(CHIP)部分流程:配制CHIP需用的试剂备用,加入一抗过夜操作实验:菌落PCR(比较不同引物克隆Oct4基因的效力)查阅资料(以引物设计为主)阅读文献讨论疑难点开组会:实验室各成员工作汇报及讨论操作实验:Gtl2基因的甲基化检测流程:把提好的DNA酶切获得目的片段制作珠子用焦亚硫酸盐处理并过夜继续操作实验:gtl2基因的甲基化检测流程:洗昨天做好的珠子PCRDNA电泳实验结果:无目的条带,失败可能原因分析:低熔点琼脂糖没完全煮融(浓度不够);珠子没洗干净;PCR引物特异性不高重复操作实验:gtl2基因的甲基化检测实验结果:无目的条带,失败7.257.267.277.287.2930查阅资料(以甲基化定量分析DNA为主)7.318.128.38.48.58.
可能原因分析:琼脂糖有问题或是没完全煮融;PCR引物特异性不高8.88.9查阅TRIzol提取法提取RNA的相关内容学习载体与目的片段连接的及其具体操作方法观摩实验:1、TRIzol提取法提取RNA2、RT-PCR操作实验:用试剂盒提取质粒参观研究生Poster展开组会:实验室各成员工作汇报及讨论论文分享操作实验:流程:洗昨天师姐做好的珠子PCRDNA电泳结果:无目的条带,失败可能原因分析:焦亚硫酸钠试剂有问题;引物特异性不高查阅资料观摩实验:转化练习使用NCBI网站中的Entrez信息查询系统检索并提取人瘦素(leptin)的各种核酸序列查阅资料体验细胞间工作环境观摩实验:转导使用倒置荧光显微镜观察IPS细胞及转导过程中的细胞8.108.118.128.13查阅资料,整理资料
结束语
整个暑期实践,掌握了IPS研究中的基本知识,了解了IPS最新的研究动态。学习了一些先进技术原理和要领,例如分子克隆,CHIP,引物设计,转化转导等。掌握了一些常用的技术及其操作,例如序列搜索等生物信息学内容,菌落PCR,实时定量PCR,甲基化检测等。熟练了一些基本实验操作,如PCR,DNA电泳等。实习给我最大的三点感触,一是,我不再只是从别人口中听,从别人文字中看,而是零距离接触自己想知道的世界,亲身经历想做的事情。二是,实习给了我主动去学习新知识的动力和毅力。三是给了我一段值得珍藏的回忆。
我没有像师兄XX,XX,同届同学XX等人那样,能在《sience》上发表文章,或者在实习单位做出了很骄人的成果,但是,我觉得自己真的带回了不少属于自己的真切的收获。二十多天的实习转眼就过去了,要离开的时候,多了沉甸甸的知识,多了一群朋友,多了几分不舍。鸣谢
感谢XX院长和辅导员XX老师,是你们搭建了这个平台。
感谢研究院的XX院长,XX老师,是你们让我的旅程得以顺利启航。感谢实验组中给予我指导的各位师兄姐,是你们充实了我的旅途。感谢每天和我一起早出晚归的同学,是你们和我并肩同行。衷心地感谢在这次实习中一起走过的所有人!
扩展阅读:暑期科研见习岗位总结报告
暑期科研见习岗位总结报告
船舶海洋与建筑工程学院杨贺学号:5090109006指导老师:林志良201*学年暑假,为了充实自己的暑期生活,拓展自己的专业视野,积累一定的科研活动经验,我申请加入了林志良老师立项的暑期实践项目《应用有限体积法模拟方腔流及台阶流问题》。在这次见习活动中,我与小组的其它三位成员围绕着计算流体力学以及FORTRAN程序语言进行了为期一个月的学习与实践。
项目内容:
此次项目的内容主要是学习有限差分的方法,使用了美国JohnD.Anderson编撰的经典教材《计算流体力学基础及其应用》。基于这本教材,我们学习了CFD的基本思想、基本方程以及基本的数值计算方法有限差分法。基于已经在大二下学习了流体力学的基础知识,此次研习的内容更侧重于离散化的基本方法、网格生成与坐标变换以及计算流体力学的基本方法。
此外,CFD的发展时刻离不开计算机技术的跟进,所有的数值计算方法最终都要依赖与计算机技术去实现。因此,本次见习的另一重点学习内容就是FORTRAN语言的使用,通过借阅相关的书籍,逐步掌握FORTRAN语言的语法规则以及逻辑形式,最终能够完成计算程序的编写。
项目经历:
六周的见习时间主要分成前四周的小组集中讨论学习以及后两周的自主编写程序。前四周每周一和周五下午为小组集中讨论时间,由林志良老师进行基本内容的讲解后,再由小组同学自行提问进行学习成果的交流与探讨。后两周由同学应用所学的数值计算方法及FORTRAN语言,针对特定的问题进行程序的编写。
在前四周的学习中,我们用两周的时间经行了教材第一部分即前三章的学习,复习了计算流体力学的控制方程并掌握了偏微分方程的一些基本知识。在大二下学期初学流体力学的时候,课堂上教授的内容更多的侧重于整个流体力学体系的构建,涉及的内容广泛而浅显,许多的问题都是采用最简化的方式近似出物理模型,流体通常都假定无粘不可压等。在第一周的流体力学方程的回顾中,我们回到最原始的流体问题,没有采取任何近似而进行方程的推导,回归最本质的NS方程,仅由质量、动量和能量三者构建出流动模型进行推导。最后才根据不同的情况需要作适当的简化近似,得到适合CFD使用的控制方程。
第二周进行偏微分方程的推导时,教材仅涉及了偏微分方程的类型及其相对应的性质,我们在图书馆找到有关偏微分方程的书籍进行了更加深入的补充学习,在讨论中不仅就书上不理解的问题进行反复争论,也一起找出相关数学知识不足的缺口,在老师的引导下制定出详实的补充书目清单,并会在之后的学习中不断跟进。
第三周我们开始接触离散化的基本方法,对于有限差分方法进行了初步的学习,了解到了隐式方法和显示方法并推导出不同稳定性方法下的误差条件。这其中对于误差的分析既是难点也是重点,然而由于数学知识的不足我们只能浅尝辄止,还有赖于之后对于偏微分方程、离散数学等知识的补充才能更深入的进行数值计算后的误差分析。
第四周我们学习的是网格的构件,这主要还是停留在理论上坐标变换的部分,如何将曲面上的网格变换成平面方形格的方程推导,实际的计算机操作还要在之后的软件学习中进一步深入。之后我们还讨论式的学习了CFD的基本方法,它们都直接应用了最原始的有限差分方法,精度较低,然而却让我们了解到了CFD最基本的方法构成,是今后对于现今CFD高级方法学习的必不可少的先修课程。
最后两周,我们尝试用FORTRAN语言编写有关于隐式格式的一个小程序,作为此次见习活动的实践内容及总结汇报。尽管编的程序还需要借鉴一部分现有的公式语言,我们已经初次体验到了数值计算与编程之间微妙的相互作用,认识到了计算机技术对于数值计算的强大辅助作用。
项目成果:
此次见习中,我们掌握了计算流体力学的基本理论知识。对于流体力学的知识有了更加深入的理解,尤其是对于流体力学基本控制方程有了更加全面的解读。对于新接触的数值计算方法,了解了最基础的数值分析理论,为今后更为深入的学习更为深入、前沿的数值计算方法打下基础。
在软件的应用上,掌握了FORTRAN语言的基本编写模式,能够使用FORTRAN语言编写小的计算程序。
见习体会:
这次见习活动历时一个多月,是我第一次走进实验室进行科研活动,开始接触计算流体力学这个研究方向。从知识积累上来看,我收获颇丰,不仅是在老师的引导下学习一门新学科的基础知识,更多的是开始尝试自主探究去学习自己感兴趣的内容。暑假的时间十分充裕,我们每个星期除了定期的开会讨论之外,有充分的自主支配时间,我们可以选择去实验室进行上机编程也可以选择去图书馆看书查资料。我们基本上都是自己安排学习时间,在完成基本教材的学习任务后,还选择性的看一些数值分析、计算方法类的书籍,养成了自觉探究学习,有针对性目的性的学习习惯。
另外,就专业方向上来看,此次见习活动也大有裨益。在大二上学期专业分流之后,我们只进行了一个学期的专业学习,对于船舶与海洋工程这个博大精深的专业还是知之甚少。在这次见习之中,我们才逐渐了解到专业的细分程度竟然如此之高,仅仅一个流体力学的数值研究也包含了构建网格、解析方法等等分支,其中每一个方向都会使我们付出一生都不能穷其究竟。这使我开始真正的了解到科学研究的严谨细致,开始对自己的专业规划有了新的想法,希望能通过这样的见习活动多接触自己有兴趣的领域,在今后的学术发展中能找到最适合自己的专业方向。
最后,此次见习活动对我影响最大的还是在于对待科学研究的态度。在前两年的本科学习中,我已经习惯了按照教务处安排的课表每天学习固定的课本,紧跟着老师的进度写作业、参加考试。然而,这一次的见习活动让我认识到,真正做科研的人需要有着明确的研究方向,并由此决定自己学习知识的内容。在进行了两年的本科学习之后,倘若现在像暑假一样每天都是自由的时间由我决定每天的研究内容和任务,我会觉得无所适从。当我看到老师和研究生们整日没有培养计划的束缚却还在通宵达旦调试程序的时候,我第一次意识到自己做科研的第一步才刚刚迈下。我需要的是踏实严谨的治学态度,明确自己的兴趣所在并扎扎实实地投身其中,脚踏实地的规划自己的学术进度。
我希望,这次见习过后还有更多的机会能够继续计算流体力学方面的研究,同时我也会在接下来的学习中不断充实自己的知识素养,让自己在数值计算方法的理论上更加扎实。
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