转丁香园：研究生科研总结
转丁香园－研究生科研总结
一、有关文献阅读和检索：对于刚刚进实验室的我们来说，检索和阅读文献是首先必须要认真做好的，这是整个研究生学习阶段最重要的一步。老师在实验室所推行的weeklyreport是非常好的培养方法，如果每一位新进实验室的研究生在整个学习阶段都能够这样执行，收获将是非常大的。下面是一些具体的做法。
1、中文文献：刚进实验室的时候，很多人都会感到很茫然，内心里有很多想法，浑身也后使不出的劲，到处都是看不完的文献，但就是不知道从哪里下手。个人感觉首先阅读CNKI和万方数据库的优秀硕博士论文对于寻找课题和开拓思路很重要。首先选好你所感兴趣的方向，下载大约10篇左右的论文，好好的读一下。等这些论文读完了，基本上对该方向的实验方法，实验思路和相关的英文单词都有了一定的了解。如果有武大的同学的话，可以上武大的数据库，相对华工的来说，它的比较全，且新一些。对于我们实验室发表的一些文章，尽量的读一些，读的懂更好，读不懂也没有关系，但需要对我们实验室有一些了解。2、英文文献：主要就是Pubmed。基本的方法就是在其检索栏中输入关键词，可以找到你所需要的大部分文献，通过学校图书馆可以下载绝大部分全文。如果不行的话可以通过以下方法获取：①Pubmed里面有个Linkout选项，当其首选数据库不能够查到全文的话，可通过Linkout链接到其他的数据库查找；②向国外通讯作者索取，有时候给别人发了email，别人不理你，不要怕，继续发，或者换个邮箱发，我们常用的163或sina有时候国外就收不到。不管别人给不给你全文都会给你答复的，越牛的人越会给你回复。③上DXY检索区求助，基本上是有求必应，特别是你的积分大于20分的时候。所以需要自己在DXY上回答别人的问题以获得积分，给别人帮助，收获的是自己。当你在Pubmed上查文献的时候，有很多重要的信息需要注意：①在Pubmed的Abstract状态下，右边是其链接全文的网址，下面是与这篇文献相关的文章，这些文章很重要，需要仔细看看。②进入全文网站之后，在全文的右侧有这篇文章被引用的次数，在文章的最后有引用改文章的文献列表，这些非常重要。③关于引用文献可以查Scopus数据库，很全很新的。查找这些引用文献，可以找到很多与你所查文章相似的文献，有时候的收获比直接在Pubmed里面查还要多得多。
3、文献整理和归纳：有时候明明查到多该文献，但过一段时间就是找不到，关键的原因是我们对文献的整理和归纳不够。个人感觉一下几点需要注意：①文章的名称一定要写明，有时候直接下的时候它都是数字或字母表示，一定要当时就更改过来，有时候文章名很长，就需要我们给其简化命名；②用关键词建立文件夹，并标明日期（如CR-201*0705）；③如果对文献管理软件如endnote或referencesmanager熟悉的话，用这两个软件管文献会非常方便，但个人感觉并不推荐这种用法，因为我们用的都是D版软件，万一那天被限制使用了就完蛋了；④经常整理，将相关的文献合并，改删的就删。
二、关于课题设计和实验手段：掌握了基本的检索方法，并且阅读了一些相关的文献之后，就需要对自己的课题做一些基本的规划。
1、课题设计：总的原则是在老板课题的范围之内选题，同时提出自己新的想法。老板的课题都是大的方向，有时候是非常好的idea，但具体的实施过程也需要我们去创新，要把握基本原则，但又不拘于表面形式，这样才能把我们的想法和老板的课题完整结合起来。个人感觉研究生开题报告是一个非常重要的培养过程，写一份开题报告非常能够锻炼能力和思维。其内容可以与老板的课题相结合，但最好是提出自己的新思路。同时如果每年每位研究生都能够写一份国家自然科学基金或省自然科学基金的标书，这种锻炼对研究生尤其重要，同时也可以给老板提供一些好的idea。2、实验手段：了解实验室常用的方法技术（从理论原理到基本的操作），精通一种实验技术（能够解决该门技术中大部分的问题）。比如我们实验室大部分人都会膜片钳，但我个人感觉精通的人并不多。实验技术只是手段，实验的思路才是最重要，同时必须掌握一门核心技术，这样就可以和人合作，与人交换。在实验上能够赢得合作者的尊重同时能够保证实验又快又顺的进行。为了掌握实验技术，对于刚进实验室的师弟师妹们来说很关键的一点就是要学会打杂，要舍得吃苦，不要怕吃亏。你给师兄师姐们做了很多无私的贡献的同时，你也学到了实验技术，同时还建立了良好的个人关系，这些非常重要。今天的付出，也许很多年后才有回报，但没有付出就永远不会有回报。吃苦耐劳，与人为善在任何时候都是适用的。三、关于论文的撰写和投稿：
论文的撰写是个非常锻炼人的过程，需要耐心，细心和平常心
1、总的一些看法：最初写英文基本就是抄，选择20篇左右的相关英文文献，将其中的关键句子标明出来，使用的时候对于语法和整个句式不要做大的修改，主要就是改一些名词，副词和形容词。在使用的时候句子来源于introduction的就用在你的introduction之中，来源于discussion就用在你的discussion之中。在撰写过程中，我们不能保证我们的用词都非常恰当，也无法保证语法不出错误，但有几点错误是绝对不能犯的：①单词拼写；②文中的插图的标注；③参考文献的引用。这几点出错的话审稿人会认为你不严谨，想当然对你的实验结果产生看法。为了保证减少以上错误，有几点可尝试：①使用word的拼写和语法功能；②将文章多给几个人看看，不要太保守，怕别人知道你在做什么；③自己在不同的时间点看看，一定要打印一份出来，这种查错方法很不错的。
2、Introduction撰写：基本上是三段式：①首先是介绍与你课题相关的前人研究进展；②提出自己想做的问题；③你做了那些内容，有一些什么基本的意义。
3、Results撰写：①你的结果相互之间没有很必然的联系，但都是为了证明你的实验，他们是并列的关系，基本上按照别人文章的排序进行就行了，自己不要搞创新，免得到时候自己都说不清楚；②结果是递进式的，如研究信号通路，按照前后次序就行；③大多数是前两种方式的混合，需要多想想，自己明白是没有用的，关键是要让别人看得懂，因此写文章时多和人交流非常重要。
4、References：建议用endnote软件进行管理，学会使用这个软件可以减少编写references的错误，可以减少工作量。软件很复杂，个人觉得知道使用以下方面就可以了：①会用endnote上pubmed查到你要的文献；②能够将你选择的文献插入到word文档中；③懂得选择适合你的参考文献方式；④如果有兴趣的话懂得编辑参考文献方式更好。
5、文章中的插图制作：①建议用PPT操作，它做出的是矢量图，结果非常清晰，用arial的字体，8-10号，excel图表直接复制到PPT中的、；②画图板和PS做出的组合图都比不上PPT；③个人感觉sigmaplot和excel做的统计图没有很大区别，是在PPT中进行组合的时候比较的；④在PPT中作图最初是不用管其像素，但其宽度一定要设定好，PPT的横图基本上就是一个页面图；⑤投文章是可以用PDF，当PPT做好后，可以用adobe软件将其转化成PDF；⑥如果需要tiff的话，在转化成的PDF中截图到PS中，然后调整像素和大小，这种方式好像比直接复制到PS中的效果要好的多。
扩展阅读：研究生科研方法期末总结
一.名词解释：
1科研设计三要素（研究对象研究因素实验/试验效应）
研究对象又称受试对象，是由研究目的所决定的具有某种特征的个体所组成的群体，是研究因素所作用的对象。
研究因素也称受试因素或处理因素。广义的研究因素是指自然存在的，或受试者本身所具有的，或自外界给予研究对象的各种因素。狭义的研究因素则是指研究者所要研究的、作用于研究对象身上可能产生效应的因素。
实验/试验效应是研究因素作用于研究对象所呈现的结局，或是研究对象对研究因素作用的反应结局。
2科研设计五原则（对照随机盲法重复均衡）
对照的原则在调查研究或实验研究的过程中，确立可供相互比较的组别。
随机的原则在抽样研究中，抽取或分配样本时，每一个研究对象或观察单位都有完全均等的机会被抽取或分配到某一组，而不受研究者或研究对象主观意愿所左右。
盲法的原则指临床研究过程指标的观测、数据的收集和结论的判断时，应在不知道研究对象的分组前提下进行。
重复的原则要求研究样本对于相应的总体具有代表性：包含研究样本应具有与相应总体的同质性足够的样本含量从研究样本所得到的结论只能推及于与样本具有相同范围、性质、特征的人群。
均衡的原则试（实）验组和对照组之间的非处理因素的一致性。均衡性是实验成败的关键。
3科学研究运用科学的观点和方法，利用已知，探索未知，创造新知的实践活动4科学假说是根据已知的科学事实和科学理论，对准备研究的课题提出一种假定解释。5抽样:6863计划中国高技术研究发展计划，7大领域：生物技术、航天技术、信息技术、激光技术、自动化技术、能源技术和新材料
7973计划国家重点基础研究发展计划，科学问题基础研究人才培养研究基地，制定和实施973计划是党中央、国务院为实施“科教兴国”和“可持续发展战略”8文献综述是以综合文献为特征的专题论文，是将一定时期内某一科学领域或专题的文献收集起来，对其提出的探索的问题进行分析归纳,综合评论，加工整理而形成的论文。二.简答论述
1.科研的三要素和五原则
科研设计三要素（研究对象研究因素实验/试验效应）
研究对象又称受试对象，是由研究目的所决定的具有某种特征的个体所组成的群体，是研究因素所作用的对象。
研究因素也称受试因素或处理因素。广义的研究因素是指自然存在的，或受试者本身所具有的，或自外界给予研究对象的各种因素。狭义的研究因素则是指研究者所要研究的、作用于研究对象身上可能产生效应的因素。
实验/试验效应是研究因素作用于研究对象所呈现的结局，或是研究对象对研究因素作用的反应结局。
科研设计五原则（对照随机盲法重复均衡）
对照的原则在调查研究或实验研究的过程中，确立可供相互比较的组别。
随机的原则在抽样研究中，抽取或分配样本时，每一个研究对象或观察单位都有完全均等的机会被抽取或分配到某一组，而不受研究者或研究对象主观意愿所左右。
盲法的原则指临床研究过程指标的观测、数据的收集和结论的判断时，应在不知道研究对象的分组前提下进行。
2.中医现代化
中医现代化按照中医自身发展规律，满足时代的需求，充分利用现代科学技术，
继承和发展优势和特色，使中医学从理论到实践都产生新的变革和升华，成为具有当代科技水平的医学理论体系的过程。
3．中医药学的优势
1系统的生命科学理论中医学的生命观、健康观、整体观、“以人为本”
2个体化的诊疗体系辨证论治、因人因时因地制宜
3整体综合调节的医疗手段和方法中药复方的多途径、多环节、多靶点调节非药物疗法的防病治病、养生保健
4丰富系统的养生保健理论和实践天人合一、法于自然、形神共调的养生保健理念和实践经验
5浩瀚的古典医籍文献信息资源6融自然、人文科学于一体的学科特色富含中华民族的古代科学深厚底蕴，是中国优秀传统文化的组成部分
4.医学领域出现的巨大转变
1疾病谱的变化感染和营养失调→代谢和调控失常2老龄化社会的形成
3医学模式的转变生物医学模式→生物－社会－心理医学模式4健康观念的转变5选题的基本原则
1需求性中医药防治重大疑难疾病：中风、肿瘤、肝炎、糖尿病、类风湿性关节炎、小儿肺炎、艾滋病、更年期综合症、肾病、抑郁证等。2创新性创新是科研的生命线3科学性科研选题、设计
4可行性是否具备实施的条件
5效能性科研投资与预期研究成果的综合效能6.科学研究的基本过程
选题问题、文献、假说
设计专业、统计、进度、人员实践观察、实验、调查
整理分类、检查、表格、汇总、统计分析讨论、结论、论文
成果结题、鉴定、报奖、转化7实验动物选择原则
相似性：尽可能近似于人类疾病、证候
可靠性：特异地、可靠地反映某种疾病，或机能、代谢、结构变化应具备该种疾病的主要症状和体征
重复性：1）限定实验动物的条件2）实验动物的样本数适用性和可控性：例如，疏肝利胆法大鼠无胆囊
易行性和经济性：例如，灵长类动物的使用8观察指标的选择原则1关联性
临床试验的关联性指标是关于疗效和安全性的指标。注意不仅从常规的解剖学、病理损害、生化指标出发，更要重视关于功能调整、生存质量提高的效应。
2客观性减少、克服研究者本身的观测性偏倚。
3精确性包括准确性与可靠性准确性反映观测值与真实值接近的程度；可靠性表示观测同一现象时，多次观测结果取得一致或接近一致的程度。
4灵敏性又称反应性。灵敏性高可以提高观测结果的阳性率，但要注意，过高的灵敏性容易造成假阳性。
5特异性特异性高的指标反映病证及效应的专属性，且常不易受其它因素干扰。
临床研究的结论，主要是从效应指标的数据分析，推导出来的。因此，一项研究的效应指标是如何选择和确定的，就成为评价该项研究结论真实性和价值的重要的部分9.临床指标的纳入标准和排除标准（1）纳入标准（InclusiveCriteria）：
合格受试者所应具备的条件。
被纳入研究的对象，除应符合诊断标准外，研究者还必须根据具体的研究目的及实施的可行性，对纳入研究的对象的其它条件同时作出规定。一般包括：①对于病情、病型、病期、病程的规定；②对年龄、性别、婚姻状况的规定；
③对职业、居住地、个人嗜好状况等的规定。（2）排除标准（ExclusiveCriteria）：
不应该被纳入研究的条件。①不符合诊断标准和纳入标准者。②虽符合诊断标准，但有下列情况之一者：同时患有其它病、证或合并症者；已接受有关治疗，可能影响对效应指标观测者伴有影响效应指标观测、判断的其它生理或病理状况，如月经周期；心、肝、肾损害，影响药物体内代谢者；某些特征人群如被纳入研究则有悖于医疗道德者，如孕妇、婴幼儿、未成年人、高龄患者、过敏体质、病情危笃或疾病的晚期患者；不合作者，如不愿意接受研究措施或因患有精神病未能合作者；其它：如住地过远，未能随访者。10.RCT实验，交叉试验和列队研究的设计方案随机对照试验（RCT)设计方案
采用随机分配的方法，将符合要求的研究对象分配到试验组和对照组，然后接受相应的试验措施，在一致的条件和环境里，同步地进行研究和观察试验效应，并用客观的效应指标，对试验结果进行测量和评价的试验设计。
RCT设计模式阳性结局（有效）试验组合格受试对象Ne阴性结局（无效）R对照组阳性结局（有效）阴性结局（无效）R随机分配试验效应时期
分析模式结果+-试验组对照组合计RCT试验结果随机对照试验结果分析四格表合计aba+bcdc+da+cb+dN范围
主要是临床治疗性或预防性研究
在特定的条件下，也可用于病因学因果效应研究还可用于非临床试验的系统工程
优点：
1可排除研究对象分组时选择性偏倚的干扰2研究对象诊断确凿
3试验研究的同步性、条件的一致性4试验期间的一致性
5研究结果在研究结束时方可获得6增强研究结果的组间可比性7增强研究结果的统计分析效能缺点：
1研究费时、人力与财力支付较大
2单个RCT研究的结果，仅限于合格的被研究对象
3安慰剂的不恰当应用，某种有害致病因子主动暴露于人体，有悖医德
对两组受试者使用两种不同的处理措施，然后将处理措施互相交换，最后将结果进行
对比分析的设计方法。
交叉试验的设计模式有效甲组：试验措施无效有效乙组：对照措施治疗期无效洗脱期试验措施治疗期对照措施有效无效有效无效NeR？本试验的每个受试者都要接受2种治疗措施，因而都有2种结果，其结果分析应采用配对卡方检验。
交叉试验的结果分析本试验的每个受试者都要接受2种治疗措施，因而都有2种结果，其结果分析应采用配对卡方检验。配对卡方四格表对照措施合计有效无效aba+bcdc+da+cb+dN有效试验措施无效合计
适用于慢性疾病的治疗效果观察，临床上主要用于对症治疗药物效果研究，或预防药物的效果观察优点：
1病人自身先后比较，可消除个体差异。
2每个受试者都先后接受2种方案的处理，得到2种结果，可减少样本含量。3随机分组可避免人为的选择性偏倚。4可用双盲法实施，且有同期对照。
缺点：
1应用范围受限，只能用于慢性复发性疾病的对症治疗。
2需要一定的洗脱期，过短则难以避免治疗的重叠作用，过长则使病人长期得不到治疗，影响病情。
3用药周期长，病人失访、退出、依从性降低等概率增加。
4各个病例很难在第二阶段治疗前与第一阶段治疗前的情况一样。队列研究
又称定群研究，是群体研究中常用的方法。设计方案类型前瞻性队列研究
回顾性队列研究（历史性队列研究）历史-前瞻性队列研究设计方案
同群体队列研究
不同同群体队列研究
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